Türkiye’deki on sekiz Özel Çevre Koruma Bölgesi’nden biri olan Fethiye-Göcek doğal, tarihi ve kültürel özellikleri nedeniyle aynı zamanda bir deniz koruma alanıdır. Nesli tehdit altındaki Akdeniz foku (Monachus monachus), deniz eriştesi (Posidonia oceanica), orfozun (Epinephelus marginatus) da aralarında bulunduğu 1500 kadar türün yaşam alanıdır. 22 Ağustos 2020 tarihli 31221 sayılı Resmi Gazete ile Körfez’deki Balıkçılığa Kapalı Alanlar(BKA) ilan edilmiştir.
Akdeniz Koruma Derneği yasa dışı av, deniz kirliliği gibi tehdit niteliğindeki faaliyetlerin engellenmesi amacıyla yetkili kamu kurumları ile 2019 yılında Deniz Koruyuculuğu Sistemini uygulamaya başladı. Bu sistemin etkinliğinin ve BKA'ların izlenmesi amacıyla makroalg türleri, balık biyokütlesi, deniz suyu sıcaklığı ve Akdeniz foku için izleme çalışmaları yürütülüyor. Bölgedeki su ürünleri kooperatifleri ile günlük balıkçılık verilerinin kaydedilmesi konusunda çalışılıyor.